男方染色体有问题可以做试管婴儿，推荐做第三代，通过植入前胚胎筛查可以选择健康的胚胎进行移植，这样大大降低了后代出现染色体异常的概率。需要注意的是，男方染色体不是必需要做供精试管婴儿的，只要能取到精子配成健康胚胎，就没有供精助孕的必要。
不同的染色体异常类型和严重程度对于试管婴儿成功率以及新生儿健康状况都会产生不同的影响，在进行试管婴儿之前，医生会详细全面的检查和评估工作，首先要检查女性卵巢功能和子宫内膜厚度等因素是否符合进行试管婴儿操作的条件，同时还需要对男方精液质量进行评估，在确定您具体患病类型后，医生将制定相应方案确保移除或者减少遗传疾病带给后代风险，并增加受孕成功率。
全部检查结果出来后，可以去正规医院建档，要携带夫妻双方身份证、结婚证返院建档，同时还要签署知情同意书，在建档完成后，可在第2天去正规医院制定适合的促排卵方案，进行促排期间要按时服用医生开的促排药，且并按照操作方法进行注射。
在促排卵期间，医生都会按时检测卵泡发育，待卵泡成熟后，便会安排注射破卵针，医生在仪器的引导下来取卵，无需开刀住院，而且整个过程全无痛。取卵当日男方也需进行取精，将其与卵子一同放到培养皿中，等待自然结合形成受精卵。
实验室培养的第三天的胚胎，再继续培养到第五天，或第六天，此过程就称为养囊，为了确保移植后成功的概率更高，但同时损失胚胎的比例也比较高，培养好的囊胚也需要采用PGD/PGS基因检测，确定囊胚有无缺陷，便于找出优质的胚胎移植，提高妊娠成功率。
经过移植前基因诊断筛查技术的囊胚可用于移植，此外，还需要根据囊胚的发育能力以及女性状态挑选移植的胚胎，医生会选择最优质、最有发育潜力的一个或多个胚胎进行移植到女性子宫内，这个过程通常不需要麻醉。
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